MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 68223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021823	T	6	6	6	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021823	AGC	2	6	28	33	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021823	A	6	6	34	39	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021823	A	6	6	70	75	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021823	ATG	2	6	86	91	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021823	CAG	2	6	99	104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021823	TTC	2	6	164	169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021823	TAC	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021823	A	6	6	285	290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021823	TCAT	2	8	291	298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021823	AAT	2	6	311	316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021823	T	6	6	419	424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021823	ATA	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021823	AAT	2	6	557	562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021823	A	6	6	604	609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021823	TTC	2	6	644	649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021823	ATT	2	6	698	703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021823	GAA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021823	AT	3	6	745	750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021823	AAAT	2	8	762	769	75 %	25 %	0 %	0 %	525865814
21	NC_021823	GTT	2	6	771	776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865814
22	NC_021823	ATT	2	6	781	786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
23	NC_021823	ATT	2	6	791	796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
24	NC_021823	TAAT	2	8	826	833	50 %	50 %	0 %	0 %	525865814
25	NC_021823	TAT	2	6	861	866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
26	NC_021823	TTC	2	6	1034	1039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865814
27	NC_021823	ATA	2	6	1042	1047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865814
28	NC_021823	A	6	6	1076	1081	100 %	0 %	0 %	0 %	525865814
29	NC_021823	ATT	2	6	1101	1106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
30	NC_021823	ATA	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865814
31	NC_021823	TGG	2	6	1183	1188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865814
32	NC_021823	ATG	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865814
33	NC_021823	ATA	2	6	1204	1209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865814
34	NC_021823	TTG	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865814
35	NC_021823	ATG	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865814
36	NC_021823	CGAAAT	2	12	1296	1307	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525865814
37	NC_021823	AGA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865814
38	NC_021823	ATG	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865814
39	NC_021823	A	6	6	1628	1633	100 %	0 %	0 %	0 %	525865814
40	NC_021823	TAT	2	6	1708	1713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
41	NC_021823	TAT	2	6	1747	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
42	NC_021823	TACA	2	8	1768	1775	50 %	25 %	0 %	25 %	525865814
43	NC_021823	GCTA	2	8	1808	1815	25 %	25 %	25 %	25 %	525865814
44	NC_021823	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865814
45	NC_021823	CAC	2	6	1850	1855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865814
46	NC_021823	TTAT	2	8	1887	1894	25 %	75 %	0 %	0 %	525865814
47	NC_021823	ATGT	2	8	1902	1909	25 %	50 %	25 %	0 %	525865814
48	NC_021823	TGG	2	6	1930	1935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865814
49	NC_021823	A	6	6	2037	2042	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
50	NC_021823	GCT	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865815
51	NC_021823	GCA	2	6	2103	2108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865815
52	NC_021823	ACC	2	6	2166	2171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865815
53	NC_021823	ACT	2	6	2194	2199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865815
54	NC_021823	AAG	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
55	NC_021823	AACAA	2	10	2333	2342	80 %	0 %	0 %	20 %	525865815
56	NC_021823	GAAATC	2	12	2346	2357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525865815
57	NC_021823	A	7	7	2372	2378	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
58	NC_021823	TCTA	2	8	2390	2397	25 %	50 %	0 %	25 %	525865815
59	NC_021823	A	6	6	2521	2526	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
60	NC_021823	CAAA	2	8	2599	2606	75 %	0 %	0 %	25 %	525865815
61	NC_021823	GCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865815
62	NC_021823	GCG	2	6	2658	2663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525865815
63	NC_021823	AGA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
64	NC_021823	T	6	6	2743	2748	0 %	100 %	0 %	0 %	525865815
65	NC_021823	GAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865815
66	NC_021823	AGT	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865815
67	NC_021823	A	7	7	2888	2894	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
68	NC_021823	CCAA	2	8	2911	2918	50 %	0 %	0 %	50 %	525865815
69	NC_021823	AAC	2	6	2957	2962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
70	NC_021823	AC	3	6	2977	2982	50 %	0 %	0 %	50 %	525865815
71	NC_021823	AAC	3	9	3014	3022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
72	NC_021823	CA	3	6	3053	3058	50 %	0 %	0 %	50 %	525865815
73	NC_021823	TCA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865815
74	NC_021823	GCCA	2	8	3077	3084	25 %	0 %	25 %	50 %	525865815
75	NC_021823	CATT	2	8	3153	3160	25 %	50 %	0 %	25 %	525865815
76	NC_021823	A	6	6	3213	3218	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
77	NC_021823	GAA	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
78	NC_021823	CATT	2	8	3433	3440	25 %	50 %	0 %	25 %	525865815
79	NC_021823	GTT	2	6	3471	3476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865815
80	NC_021823	AGA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
81	NC_021823	ATG	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865815
82	NC_021823	A	6	6	3591	3596	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
83	NC_021823	AGA	2	6	3602	3607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
84	NC_021823	AAT	3	9	3636	3644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865815
85	NC_021823	GAC	2	6	3666	3671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525865815
86	NC_021823	ACA	2	6	3685	3690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
87	NC_021823	A	6	6	3718	3723	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
88	NC_021823	A	7	7	3733	3739	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
89	NC_021823	AAC	2	6	3748	3753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
90	NC_021823	CAAA	2	8	3818	3825	75 %	0 %	0 %	25 %	525865815
91	NC_021823	TCGGA	2	10	3832	3841	20 %	20 %	40 %	20 %	525865815
92	NC_021823	CAA	2	6	3850	3855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865815
93	NC_021823	TTG	2	6	3892	3897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865815
94	NC_021823	A	6	6	3930	3935	100 %	0 %	0 %	0 %	525865815
95	NC_021823	GAA	2	6	3951	3956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
96	NC_021823	TAA	2	6	3977	3982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865815
97	NC_021823	AAG	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865815
98	NC_021823	CGT	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865815
99	NC_021823	CTA	2	6	4047	4052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865815
100	NC_021823	GCCGGA	2	12	4069	4080	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525865815
101	NC_021823	GAG	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525865815
102	NC_021823	GAA	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865816
103	NC_021823	TCA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865816
104	NC_021823	ATT	2	6	4212	4217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
105	NC_021823	TTA	2	6	4218	4223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
106	NC_021823	T	6	6	4232	4237	0 %	100 %	0 %	0 %	525865816
107	NC_021823	TAT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
108	NC_021823	CAAAT	2	10	4339	4348	60 %	20 %	0 %	20 %	525865816
109	NC_021823	AAG	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865816
110	NC_021823	T	6	6	4543	4548	0 %	100 %	0 %	0 %	525865816
111	NC_021823	TCA	2	6	4591	4596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865816
112	NC_021823	AGATG	2	10	4637	4646	40 %	20 %	40 %	0 %	525865816
113	NC_021823	TTA	2	6	4713	4718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865816
114	NC_021823	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865816
115	NC_021823	TGT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525865816
116	NC_021823	GAA	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865816
117	NC_021823	AG	3	6	4956	4961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021823	AGG	2	6	4977	4982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021823	GGA	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021823	AGA	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865817
121	NC_021823	TTA	2	6	5042	5047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865817
122	NC_021823	A	6	6	5120	5125	100 %	0 %	0 %	0 %	525865817
123	NC_021823	GGTT	2	8	5143	5150	0 %	50 %	50 %	0 %	525865817
124	NC_021823	AAAC	2	8	5498	5505	75 %	0 %	0 %	25 %	525865817
125	NC_021823	ATC	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525865817
126	NC_021823	ATT	2	6	5609	5614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525865817
127	NC_021823	TCT	2	6	5652	5657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865817
128	NC_021823	A	6	6	5661	5666	100 %	0 %	0 %	0 %	525865817
129	NC_021823	GTC	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865817
130	NC_021823	CTT	2	6	5823	5828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525865817
131	NC_021823	CTTT	2	8	5848	5855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021823	AGATTT	2	12	5862	5873	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021823	T	6	6	5871	5876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021823	TACT	2	8	5930	5937	25 %	50 %	0 %	25 %	525865818
135	NC_021823	TAA	2	6	5979	5984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865818
136	NC_021823	CTGAA	2	10	5990	5999	40 %	20 %	20 %	20 %	525865818
137	NC_021823	ATGG	2	8	6031	6038	25 %	25 %	50 %	0 %	525865818
138	NC_021823	GAT	4	12	6048	6059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865818
139	NC_021823	TGA	2	6	6090	6095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865818
140	NC_021823	GAA	2	6	6157	6162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865818
141	NC_021823	CAAAT	2	10	6215	6224	60 %	20 %	0 %	20 %	525865819
142	NC_021823	GAA	3	9	6247	6255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865819
143	NC_021823	GACGGC	2	12	6307	6318	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525865819
144	NC_021823	GAAA	2	8	6329	6336	75 %	0 %	25 %	0 %	525865819
145	NC_021823	A	6	6	6344	6349	100 %	0 %	0 %	0 %	525865819
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155	NC_021823	ATG	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525865819
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157	NC_021823	GGT	2	6	7180	7185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525865819
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159	NC_021823	CAA	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525865819
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163	NC_021823	ATA	2	6	7385	7390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865819
164	NC_021823	CTG	2	6	7397	7402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525865819
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170	NC_021823	AAT	2	6	7839	7844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865820
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402	NC_021823	CAC	2	6	17573	17578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525865829
403	NC_021823	AAT	2	6	17680	17685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865829
404	NC_021823	AAT	2	6	17707	17712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865829
405	NC_021823	TCC	2	6	17896	17901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525865829
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413	NC_021823	CCA	2	6	18490	18495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
414	NC_021823	ATTT	2	8	18502	18509	25 %	75 %	0 %	0 %	525865831
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433	NC_021823	ATA	2	6	19535	19540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525865831
434	NC_021823	T	6	6	19544	19549	0 %	100 %	0 %	0 %	525865831
435	NC_021823	T	7	7	19551	19557	0 %	100 %	0 %	0 %	525865831
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440	NC_021823	TCC	2	6	19762	19767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_021823	AAAAC	2	10	19789	19798	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
442	NC_021823	TAA	2	6	19821	19826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_021823	T	6	6	19899	19904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_021823	T	7	7	19923	19929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_021823	A	7	7	19944	19950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_021823	GA	3	6	19967	19972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_021823	T	7	7	20019	20025	0 %	100 %	0 %	0 %	525865832
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475	NC_021823	CAT	2	6	20978	20983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_021823	TATT	2	8	21122	21129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_021823	A	7	7	21136	21142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_021823	CAAA	2	8	21143	21150	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
479	NC_021823	T	7	7	21151	21157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_021823	T	6	6	21183	21188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_021823	ATT	2	6	21192	21197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_021823	AGA	2	6	21200	21205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
483	NC_021823	ATT	3	9	21209	21217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_021823	TA	3	6	21282	21287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_021823	ATT	2	6	21299	21304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_021823	AGA	2	6	21553	21558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525865833
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493	NC_021823	A	6	6	21617	21622	100 %	0 %	0 %	0 %	525865833
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